Методологијата се темели на четири меѓусебно надополнувачки столба:
Стратешка анализа – дали проектот има оправданост низ политиките на ЕУ
Оперативна анализа – дали проектот е реално изводлив
Анализа на ризици – кои закани можат да влијаат врз реализацијата
Експертски препораки – каква проектна одлука треба да се донесе
Секој столб е разработен на посебна подстраница и претставува дел од кохерентен процес на оценување на проекти финансирани од средствата на Европската Унија.